SMARTer? ThruPLEX? Plasma-Seq Kit：cfDNA
Rubicon SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit
Code No.? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 產(chǎn)品名稱
R400679 ??SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
R400680 ??SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
R400681 ??SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
R400682 ??SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
降解
? 包含單體，二聚體，三聚體的核小體DNA
? 成分和產(chǎn)量高度可變（病人和疾病相關(guān)）
? 小分子，分子大?。?70 bp ）
高品質(zhì)的游離DNA (cell free DNA) NGS文庫(kù)構(gòu)建
SMARTer??ThruPLEX??Plasma-Seq Kit
· 專為cfDNA設(shè)計(jì)：經(jīng)過(guò)優(yōu)化的修復(fù)及連接試劑
· 高品質(zhì)NGS文庫(kù)：高的文庫(kù)多樣性，在寬廣的GC含量范圍內(nèi)，可以達(dá)到高檢測(cè)再現(xiàn)性
· 起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量
· 快速簡(jiǎn)便：1個(gè)反應(yīng)管、2小時(shí)、3步反應(yīng)的簡(jiǎn)單操作，無(wú)需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟
· 應(yīng)用領(lǐng)域：液態(tài)活檢、ctDNA、目標(biāo)區(qū)域測(cè)序等領(lǐng)域文庫(kù)構(gòu)建
· 兼容自動(dòng)化平臺(tái)：Beckman FXP Workstation
■?產(chǎn)品說(shuō)明：
SMARTer ThruPLEX Plasma-seq Kit基于ThruPLEX技術(shù)，并用于血漿來(lái)源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫(kù)構(gòu)建。該試劑已針對(duì)cfDNA 進(jìn)行了專門(mén)優(yōu)化，在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上，盡可能的提升了文庫(kù)的復(fù)雜度。文庫(kù)可用于CNV分析、全基因組測(cè)序分析或是采用一些panel針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect and Roche NimbleGen SeqCap EZ。
SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述，需要單獨(dú)購(gòu)買(mǎi)。
使用SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq試劑盒制備的文庫(kù)，提供了更高的靈敏度，可以更好地了解血漿樣本中基因變異結(jié)果。與其它液態(tài)活檢的樣品一樣，血漿由于其易獲得、價(jià)值高的特點(diǎn)，在某些研究領(lǐng)域，如對(duì)腫瘤學(xué)的轉(zhuǎn)化研究或者對(duì)孕婦血漿中胎兒游離DNA 的發(fā)育學(xué)研究，深受科研工作者的重視。
兼容主要靶標(biāo)富集平臺(tái)：Agilent SureSelect?, Roche Nimblegen? SeqCap? EZ, 和 IDT xGen? Lockdown? probes
兼容Beckman Biomek FXP ：需要與Beckman聯(lián)絡(luò)獲得流程和scripts
Rubicon SMARTer ThruPLEX Plasma-Seq Kit
主要應(yīng)用：
全基因組測(cè)序，外顯子測(cè)序，靶向測(cè)序
Takara&Clontech NGS系列制品，SMARTer? ThruPLEX? Plasma-Seq：cfDNA分析
SMARTer DNA HT dual index kits
SMARTer DNA HT dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒。這些試劑盒包含Illumina Nextera??XT v2 index序列對(duì)應(yīng)的index引物，最多可提供384種不同的雙端index，用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分。其中index引物預(yù)先分裝在4個(gè)不同條形碼標(biāo)記的index微孔板中，每個(gè)微孔板可提供不同的96種index組合（Code No.R400660-R400663），index微孔板（96N Sets A-D）的每個(gè)孔提供的量足夠進(jìn)行一次測(cè)序反應(yīng)；另一種是一套中有24個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)管，每個(gè)反應(yīng)管中包含不同的雙端index組合（Code No.R400664），且每個(gè)反應(yīng)管（24N）提供的量足夠進(jìn)行兩次測(cè)序反應(yīng)。
SMARTer DNA unique dual index kits
SMARTer DNA unique dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒。這些試劑盒包含“IDT for Illumina UD”對(duì)應(yīng)的index引物，最多可提供96種不同雙端index，用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的4組各24個(gè)單獨(dú)的管中，其中每組可提供24種不同index引物組合（Code No.R400665-R400668）。每個(gè)index引物管（24U Sets A-D）提供的量足夠進(jìn)行兩次測(cè)序反應(yīng)。
SMARTer DNA single index kits
SMARTer DNA single index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用，用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒。這些試劑盒包含與“TruSeq LT set A”序列對(duì)應(yīng)的index引物，可提供24種單端index，用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的2組各12個(gè)單獨(dú)的管中，其中每組可提供12種不同index引物組合（Code No.R400695和R400697）。每個(gè)index引物管（12U Sets A-B）提供的量足夠進(jìn)行8次測(cè)序反應(yīng)。
